Proteiinien monimuotoisuus johtuu epigeneettisestä säätelystä

Solu kykenee käyttämään DNA:ta erittäin tehokkaasti. Yhtä ja samaa DNA-jaksoa lukemalla solu voi valmistaa tuhansia erilaisia proteiineja muuttamatta DNA:ta. Tunnetuin DNA-jakso, josta solu voi vaihtoehtoisen silmukoinnin avulla tuottaa jopa 32'000 erilaista proteiinia, on hedelmäkärpäsen Dscam-jakso. Tällainen DNA:n monitoiminnallinen hyötykäyttö kertoo paitsi DNA:n passiivisesta luonteesta digitaalisena informaatiovarantona, myös siitä, ettei proteiinien valmistusohjeet ole DNA:ssa.

Oheinen tutkimus kertoo varsin yksiselitteisesti, että vaihtoehtoista silmukointia, joka siis on proteiinidiversiteetin takana, ohjaavat epigeneettiset mekanismit ja tekijät.

https://www.cell.com/fulltext/S0092-8674(10)01378-4

"These insights suggest that epigenetic regulation determines not only what parts of the genome are expressed but also how they are spliced."

"A major recent discovery is that chromatin structure and epigenetic histone modifications act as key regulators of alternative splicing."

"These observations point to a role for epigenetic modifications in the regulation of alternative splicing, and this regulation may involve the modulation of RNA Pol II elongation rate."

"An advantage of such a histone-based alternative splicing regulatory system is that it would provide an epigenetic memory for splicing decisions that could be passed on during proliferation of a cell population and could be modified during differentiation without the requirement to establish a new set of alternative splicing rules at each step of differentiation. Obviously, an epigenetic alternative splicing memory would still require the proper expression of splicing factors, a process that itself may be controlled by epigenetic mechanisms. Regardless of mechanisms, it appears that epigenetic regulation is not limited to controlling what regions of the genome are expressed, but also how they are spliced."
8151
Äänestä

Muut lukivat myös

Vastaukset 8

Vanhimmat

Ja tämä todistaa sinun jumalan olemassa olon ja sen että se olisi luonut jotain miten?

Äänestä

Silti vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat soluissa valmistettavat proteiinit, joiden koodi on DNA:ssa.

”Alternative splicing is modulated by many proteins which interact with a large array of splicing enhancer and splicing suppressor sequences.”

”Splicing outcome is commonly affected by extracellular stimuli and signaling cascades that converge on RNA-binding splicing regulators. These trans-acting factors recognize cis-elements in pre-mRNA transcripts to affect spliceosome assembly and splice site

https://www.sciencedirect.com/topics/neuroscience/alternative-splicing

Kouhottamasi epigenetiikka on ihan vaan normaaleja geenien säätelyverkostojen kaskadeja, joissa geenien ohjauksessa tuotetut proteiinit säätelevät toisia geenejä.

”Trans-regulatory elements (TRE) are DNA sequences encoding upstream regulators (ie. trans-acting factors), which may modify or regulate the expression of distant genes. Trans-acting factors interact with cis-regulatory elements to regulate gene expression.”

https://en.m.wikipedia.org/wiki/Trans-regulatory_element

Äänestä
  • Aloittaja

    //Silti vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat soluissa valmistettavat proteiinit, joiden koodi on DNA:ssa.//

    Väärin. Vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat epigeneettiset mekanismit ja tekijät, kuten DNA:n metylaatioprofiilit, histonien epigeneettiset merkinnät sekä koodaamattomien RNA-molekyylien epigeneettiset merkinnät. Transkriptioon osallistuvat transkriptiotekijät, jotka ovat itsekin vaihtoehtoisen silmukoinnin tuloksena syntyneitä proteiineja.

    DNA:ssa ei ole proteiinien koodia. DNA on passiivista informaatiovarantoa, jota solu lukee eri paikoista genomia. Luettuja jaksoja yhdistellään, leikellään ja modifioidaan. Näin saadaan mRNA, joka on valmis käännösprosessiin.

    On se kumma, ettet voi ymmärtää tätä asiaa, vaikka olen kirjoittanut sinulle useita esimerkkejä. Jos kerran solu voi valmistaa kymmeniätuhansia erilaisia proteiineja samaa DNA-jaksoa lukemalla, niin miten voit väittää, että proteiinien koodi on DNA:ssa?

    Hakusanat jokaiselle, joka haluaa tarkistaa Strong-atheistin tietämättömyyden:

    alternative splicing epigenetic regulation
    alternative splicing DNA methylation
    alternative splicing non coding RNA
    alternative splicing histone epigenetic markers

    1Äänestä

  • RaamattuOnTotuus kirjoitti:

    //Silti vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat soluissa valmistettavat proteiinit, joiden koodi on DNA:ssa.//

    Väärin. Vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat epigeneettiset mekanismit ja tekijät, kuten DNA:n metylaatioprofiilit, histonien epigeneettiset merkinnät sekä koodaamattomien RNA-molekyylien epigeneettiset merkinnät. Transkriptioon osallistuvat transkriptiotekijät, jotka ovat itsekin vaihtoehtoisen silmukoinnin tuloksena syntyneitä proteiineja.

    DNA:ssa ei ole proteiinien koodia. DNA on passiivista informaatiovarantoa, jota solu lukee eri paikoista genomia. Luettuja jaksoja yhdistellään, leikellään ja modifioidaan. Näin saadaan mRNA, joka on valmis käännösprosessiin.

    On se kumma, ettet voi ymmärtää tätä asiaa, vaikka olen kirjoittanut sinulle useita esimerkkejä. Jos kerran solu voi valmistaa kymmeniätuhansia erilaisia proteiineja samaa DNA-jaksoa lukemalla, niin miten voit väittää, että proteiinien koodi on DNA:ssa?

    Hakusanat jokaiselle, joka haluaa tarkistaa Strong-atheistin tietämättömyyden:

    alternative splicing epigenetic regulation
    alternative splicing DNA methylation
    alternative splicing non coding RNA
    alternative splicing histone epigenetic markers

    Kun väität noin..:

    "Vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat epigeneettiset mekanismit ja tekijät,.."

    ... niin miten nuo tekijät siirtyvät uuden yksilön sikiöön, kun aluksi käytössä on vain hedelmöitynyt munasolu ja sen DNA?

    Äänestä

  • RaamattuOnTotuus kirjoitti:

    //Silti vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat soluissa valmistettavat proteiinit, joiden koodi on DNA:ssa.//

    Väärin. Vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat epigeneettiset mekanismit ja tekijät, kuten DNA:n metylaatioprofiilit, histonien epigeneettiset merkinnät sekä koodaamattomien RNA-molekyylien epigeneettiset merkinnät. Transkriptioon osallistuvat transkriptiotekijät, jotka ovat itsekin vaihtoehtoisen silmukoinnin tuloksena syntyneitä proteiineja.

    DNA:ssa ei ole proteiinien koodia. DNA on passiivista informaatiovarantoa, jota solu lukee eri paikoista genomia. Luettuja jaksoja yhdistellään, leikellään ja modifioidaan. Näin saadaan mRNA, joka on valmis käännösprosessiin.

    On se kumma, ettet voi ymmärtää tätä asiaa, vaikka olen kirjoittanut sinulle useita esimerkkejä. Jos kerran solu voi valmistaa kymmeniätuhansia erilaisia proteiineja samaa DNA-jaksoa lukemalla, niin miten voit väittää, että proteiinien koodi on DNA:ssa?

    Hakusanat jokaiselle, joka haluaa tarkistaa Strong-atheistin tietämättömyyden:

    alternative splicing epigenetic regulation
    alternative splicing DNA methylation
    alternative splicing non coding RNA
    alternative splicing histone epigenetic markers

    ”Väärin.”

    Höpsistä, etkö osaa englantia vai mistä tässä jankuttamisessa on kyse? Rautalangasta väännettynä:

    ”Alternative splicing is modulated by many PROTEINS...”

    ”Trans-regulatory elements (TRE) are DNA SEQUENCES upstream regulators (ie. trans-acting factors), which may modify or regulate the expression of distant genes.”

    Toki onhan se hämmentävää kreationistille, miten niin yksinkertaisilla säännöillä saadaan kaksiulotteisesta vain viiden erilaisen emäksen jonosta syntymään kolmiulotteisia bodyplaneja, joissa ei ole mitään Jumalan suunnitelmaa. Riittää vain signaalimolekyylit ja geenien säätelyverkostot, joiden perusteella solut tunnistavat paikkansa muiden solujen suhteen ja sen perusteella säätelevät transkriptiota. Tässä esimerkkinä aukkogeenit, jotka olivat 1880 -luvulla evolutiivisen kehitysopin ensimmäisiä ja perustavanlaatuisia löytöjä. Ja ennen kuin kouhkaat vääristä/vanhentuneista tuloksista niin löytäjät palkittiin Nobelilla tästä.

    https://en.m.wikipedia.org/wiki/Gap_gene

    Äänestä

  • Strong-atheist kirjoitti:

    ”Väärin.”

    Höpsistä, etkö osaa englantia vai mistä tässä jankuttamisessa on kyse? Rautalangasta väännettynä:

    ”Alternative splicing is modulated by many PROTEINS...”

    ”Trans-regulatory elements (TRE) are DNA SEQUENCES upstream regulators (ie. trans-acting factors), which may modify or regulate the expression of distant genes.”

    Toki onhan se hämmentävää kreationistille, miten niin yksinkertaisilla säännöillä saadaan kaksiulotteisesta vain viiden erilaisen emäksen jonosta syntymään kolmiulotteisia bodyplaneja, joissa ei ole mitään Jumalan suunnitelmaa. Riittää vain signaalimolekyylit ja geenien säätelyverkostot, joiden perusteella solut tunnistavat paikkansa muiden solujen suhteen ja sen perusteella säätelevät transkriptiota. Tässä esimerkkinä aukkogeenit, jotka olivat 1880 -luvulla evolutiivisen kehitysopin ensimmäisiä ja perustavanlaatuisia löytöjä. Ja ennen kuin kouhkaat vääristä/vanhentuneista tuloksista niin löytäjät palkittiin Nobelilla tästä.

    https://en.m.wikipedia.org/wiki/Gap_gene

    *1980-luvulla

    Äänestä

  • RaamattuOnTotuus kirjoitti:

    //Silti vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat soluissa valmistettavat proteiinit, joiden koodi on DNA:ssa.//

    Väärin. Vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat epigeneettiset mekanismit ja tekijät, kuten DNA:n metylaatioprofiilit, histonien epigeneettiset merkinnät sekä koodaamattomien RNA-molekyylien epigeneettiset merkinnät. Transkriptioon osallistuvat transkriptiotekijät, jotka ovat itsekin vaihtoehtoisen silmukoinnin tuloksena syntyneitä proteiineja.

    DNA:ssa ei ole proteiinien koodia. DNA on passiivista informaatiovarantoa, jota solu lukee eri paikoista genomia. Luettuja jaksoja yhdistellään, leikellään ja modifioidaan. Näin saadaan mRNA, joka on valmis käännösprosessiin.

    On se kumma, ettet voi ymmärtää tätä asiaa, vaikka olen kirjoittanut sinulle useita esimerkkejä. Jos kerran solu voi valmistaa kymmeniätuhansia erilaisia proteiineja samaa DNA-jaksoa lukemalla, niin miten voit väittää, että proteiinien koodi on DNA:ssa?

    Hakusanat jokaiselle, joka haluaa tarkistaa Strong-atheistin tietämättömyyden:

    alternative splicing epigenetic regulation
    alternative splicing DNA methylation
    alternative splicing non coding RNA
    alternative splicing histone epigenetic markers

    Taaskaan ei myönnä olevansa väärässä..

    Äänestä

Uskon tuloksen jos he ovat eristäneet ja "nähneet" ne tuhannet proteiinit.
Teoria ja DNAn monimuotoinen hyötykäytö on silti ihailtavaa ihmettä Jumalaltamme.

Mutta pitkälle vedetty teoreettinen johtopäätös ja luulo tuhansista proteiineista ilman todisteita muuttaa vain ihmeen valheeksi.
Eli tiede muuttaa ihmeet omaksi hyötykäyttöpahuudekseen esim väittämällä että ihniseen sopii näin ollen piikittää miljoonia proteiineja ilman vaaraa.

Äänestä

Kommentoi aloitusta


RaamattuOnTotuus kirjoitti:

Solu kykenee käyttämään DNA:ta erittäin tehokkaasti. Yhtä ja samaa DNA-jaksoa lukemalla solu voi valmistaa tuhansia erilaisia proteiineja muuttamatta DNA:ta. Tunnetuin DNA-jakso, josta solu voi vaihtoehtoisen silmukoinnin avulla tuottaa jopa 32'000 erilaista proteiinia, on hedelmäkärpäsen Dscam-jakso. Tällainen DNA:n monitoiminnallinen hyötykäyttö kertoo paitsi DNA:n passiivisesta luonteesta digitaalisena informaatiovarantona, myös siitä, ettei proteiinien valmistusohjeet ole DNA:ssa.

Oheinen tutkimus kertoo varsin yksiselitteisesti, että vaihtoehtoista silmukointia, joka siis on proteiinidiversiteetin takana, ohjaavat epigeneettiset mekanismit ja tekijät.

https://www.cell.com/fulltext/S0092-8674(10)01378-4

"These insights suggest that epigenetic regulation determines not only what parts of the genome are expressed but also how they are spliced."

"A major recent discovery is that chromatin structure and epigenetic histone modifications act as key regulators of alternative splicing."

"These observations point to a role for epigenetic modifications in the regulation of alternative splicing, and this regulation may involve the modulation of RNA Pol II elongation rate."

"An advantage of such a histone-based alternative splicing regulatory system is that it would provide an epigenetic memory for splicing decisions that could be passed on during proliferation of a cell population and could be modified during differentiation without the requirement to establish a new set of alternative splicing rules at each step of differentiation. Obviously, an epigenetic alternative splicing memory would still require the proper expression of splicing factors, a process that itself may be controlled by epigenetic mechanisms. Regardless of mechanisms, it appears that epigenetic regulation is not limited to controlling what regions of the genome are expressed, but also how they are spliced."

Anonyymi
5000

Ilmoita asiaton sisältö

  • Sisältää materiaalia, joka on loukkaavaa, herjaavaa, rasistista, uhkailevaa tai ahdistelevaa.

  • Materiaali sisältää nimiä, yhteystietoja tai muita henkilökohtaisia tietoja. Julkisuuden henkilöistä, julkisissa viroissa toimivista ihmisistä sekä yritysten vastuuhenkilöistä saa keskustella työhön liittyen. Myös yksityiselämään liittyvistä asioista voi keskustella siltä osin, kuin niistä on julkisesti kerrottu.

  • Sisältää lapsille haitallista tai heiltä kiellettyä materiaalia. Seksuaalinen sisältö on sallittua aiheeseen tarkoitetuilla palstoilla, joiden ikäraja on 18 vuotta.

  • Lainvastaista sisältöä voi olla mm. yksityiselämää loukkaavan tiedon levitys, kiihottaminen kansanryhmää vastaan, laiton uhkaaminen, alaikäisiin liittyvä seksuaalinen sisältö/grooming, petokset, identiteettivarkaudet, kunnianloukkaukset ja tekijänoikeusrikkomukset.

  • Sisältö ei liity palstan tai keskusteluketjun aiheeseen.

  • Viesti ei ole suomea tai ruotsia (pl. International Forums), se sisältää mainontaa, se sisältää tekijänoikeuksin suojattua materiaalia, se on massapostitus tai jokin muu syy.

Jaa keskustelu